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银行卡注销后，短信服务费是否需要补扣，主要取决于与银行的合同或协议规定。
如果银行卡注销后仍然产生短信服务费，银行可能会要求补扣这些费用，这是因为注销银行卡并不意味着之前签订的短信服务协议自动终止，银行可能会继续按照协议收取相关费用，在注销银行卡之前，建议查看与该银行的协议或合同，了解是否有未结清的短信服务费或其他费用。
如果确实需要补扣短信服务费，可以与银行客服联系了解具体费用情况和处理方式，如果认为银行存在不合理的收费情况，也可以向银行提出申诉或咨询相关监管部门。
不同银行对于注销银行卡后的短信服务费处理可能会有所不同，具体情况需以各银行规定为准。